Основные направления деятельности ЦКП

1.      Создание и поддержка информационной и программно-аппаратной инфраструктуры, объединяющей через специализированные сети передачи данных суперкомпьютерные вычислительные комплексы и объемные хранилища данных с уникальными высокопроизводительными экспериментальными установками для решения задач геномики, протеомики, масс-спектрометрии, микроскопии и томографии.

2.      Компьютерная и информационная поддержка исследований и разработок, выполняемых в рамках программы «Геномика, протеомика, биоинформатика» включая решение следующих задач:

• обработка первичных данных, получаемых с использованием экспериментальных технологий геномики, протеомики, масс-спектрометрии, микроскопии, томографии;
• обеспечение доступа к распределенным мировым информационным ресурсам в области геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики, генетики, молекулярной и клеточной биологии, физиологии, фармакологии, биомедицины, биотехнологии и др.;
• разработка алгоритмов и методов обработки и хранения биологических данных;
• поддержка высокопроизводительных, параллельных, распределенных вычислений и Web-сервисов в биоинформатике;
• компьютерное моделирование живых систем на различных уровнях их иерархической организации;
• планирование экспериментов с использованием методов биоинформатики и системной биологии;
• разработка новых экспериментально-компьютерных технологий для системной биологии.

3.      Повышение квалификации сотрудников в области компьютерной биологии, биоинформатики и высокопроизводительных вычислений в науках о жизни; подготовка специалистов, владеющих методами биоинформатики, теоретического и компьютерного анализа и моделирования, необходимыми для решения широкого круга фундаментальных и прикладных проблем биологии, физиологии и биомедицины, фармакологии и биотехнологии.

При возникновении новых научных направлений и задач в число учредителей могут быть включены другие организации на основании дополнений к Договору о научно-техническом сотрудничестве в рамках Межинститутского распределенного ЦКП «Биоинформатика».

В рамках ЦКП функционируют следующие научно-технологические секции:

• компьютерная геномика и транскриптомика (ИЦиГ СО РАН);
• компьютерная протеомика (ИЦиГ СО РАН, МНТЦ);
• статистический анализ биологических данных (ИЦиГ СО РАН);
• математическое моделирование биологических систем и процессов (ИЦиГ СО РАН, ИМ СО РАН);
• эволюционная биоинформатика (ИЦиГ СО РАН);
• популяционно-генетический и сегрегационный анализ (ИЦиГ СО РАН);
• моделирование макромолекул методами молекулярной динамики и механики (ИЦиГ СО РАН, ИХБФМ СО РАН);
• анализ текстов научных публикаций (ИМ СО РАН, ИЦиГ СО РАН);
• астробиология (ИК СО РАН);
• высокопроизводительные вычисления в биоинформатике (ИЦиГ СО РАН и ИВМиМГ СО РАН);
• математические проблемы биоинформатики (ИЦиГ СО РАН, ИМ СО РАН);
• информационно-телекоммуникационные технологии в биоинформатике.

Подробнее: https://ckp.icgen.ru/sccbio/